Le calcul des périodes de retour de niveaux marins à la côte est primordial pour la caractérisation des submersions marines et la gestion des risques côtiers. Or, les submersions marines sont des événements complexes qui dépendent de plusieurs phénomènes partiellement liés : la marée, les surcotes atmosphériques et les vagues. L'étude d'une seule variable n'est donc pas suffisante pour déterminer la période de retour d'un niveau marin à la côte. L'analyse en probabilités conjointes permet de prendre en compte la dépendance entre les variables et ainsi de mieux caractériser les conditions hydrodynamiques d'un site donné. Les résultats de l'analyse statistique peuvent ensuite servir de base pour améliorer les calculs de période de retour de niveaux marins à la côte. Le présent article est un retour d'expérience sur l'analyse en probabilités conjointes de séries de vagues et de niveaux d'eau au large de Saint-Jean-de-Luz, sur la côte basque française. La méthode mise en oeuvre est celle du code Join-Sea, développé par HR Wallingford et l'université de Lancaster. Les résultats de l'analyse statistique sont détaillés, puis deux approches permettant d'estimer la période de retour d'un niveau marin à la côte sont présentées et comparées.